[ec2-user@ip-10-x-x-x mnt]$ sudo git clone git@xxx.xxx.xxx.xxx:hoge/hoge.git
Cloning into ‘hoge’…
Permission denied (publickey).
fatal: Could not read from remote repository.
当たり前じゃん! .ssh/configを置いたのは ec2-user ユーザー側のホームでした・・・ sudoしたらroot側に必要になっちゃいますね。
きちんとchown/chmodしてディレクトリ作ってからcloneしないとダメってことで。